近日,广东工业大学生物医药学院教授林章凛团队与华南理工大学生物学院副教授杨晓锋团队合作,在《细胞报告》期刊发表了重要研究成果。该研究团队成功构建了一种名为 DeepMineLys 的新型人工智能框架,并利用它发现了迄今为止在人类微生物组中最有效的溶菌酶。
DeepMineLys 的核心在于利用人工智能技术,对人类微生物宏基因组数据进行深度挖掘,从而识别和筛选出具有治疗耐药菌潜力的溶菌酶。这标志着人工智能技术在生物学研究领域取得了重大突破。
DeepMineLys 的成功并非偶然。该框架的构建基于几个关键因素,包括:构建涵盖广泛溶菌酶的全面训练数据集,集成 TAPE 等先进算法和编码技术,采用三层卷积神经网络和双轨架构等。这些因素共同作用,极大地提升了 DeepMineLys 的预测性能。
研究团队从前 100 个候选溶菌酶中随机选择了 16 个进行实验验证,结果令人惊喜:其中 11 个被证实具有活性,其中最强的一个溶菌酶的活性甚至比传统溶菌酶高出 6.2 倍,成为迄今为止在人类微生物组中发现的最有效的溶菌酶。
林章凛教授表示,DeepMineLys 的应用范围并不局限于挖掘溶菌酶,它也具备挖掘其他类型蛋白质的潜力。因此,DeepMineLys 的构建为未来生物学研究提供了一个强有力的工具。
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